O NAFEUM tem desenvolvido trabalhos na área de Atenção e Assistência Farmacêutica. Atualmente possui três grandes linhas de pesquisa uma envolvendo a serviços clínicos farmacêuticos e de orientação para o uso racional de medicamentos; uma segunda linha na área de Assistência farmacêutica com trabalhos de diagnóstico da situação da Assistência Farmacêutica Municipal; e uma terceira linha na área de estudos de Utilização de Medicamentos, com trabalhos de investigação do uso no sentido de avaliar a racionalidade das prescrições e do uso, com ênfase na adesão terapêutica.