Este grupo têm origem a partir da criação do Laboratório de Oceanografia Química da UESC, em 2001. No ano de 2000, foram coletados dados secundários de estuários entre o MA e RJ (projeto CONOCE), para modelagem através das diretrizes do LOICZ/IGBP. Têm sido desenvolvidas atividades de pesquisa no estuário do Rio Cachoeira, avaliando as fontes antrópicas e naturais de elementos biogênicos, sua distribuição espacial e temporal, e obtendo estimativas de taxas de processos de produção/respiração e fixação de N/denitrificação através de balanço de massa e relações estequiométricas. Estes dados resultaram em três dissertações de mestrado defendidas. Outra dissertação fez a comparação entre qualidade da água de dois estuários de pequeno porte (rios Acuípe e Cururupe), o último sujeito ao aporte de chorume. As características físico-químicas, o sistema dióxido de carbono/água, e o metabolismo líquido de poças de maré no topo de ambientes recifais também têm sido objeto de estudo. Experimentos in situ e de laboratório foram conduzidos em outra dissertação, avaliando o efeito do aumento da temperatura da água e da pressão parcial de dióxido de carbono sobre o metabolismo e calcificação no coral pétreo Siderastrea stellata. A biomassa de zooxantelas e cianobactérias perfurantes em colônias desta espécie de coral foi avaliada em uma monografia de especialização. Uma dissertação em andamento irá comparar as variáveis físico-químicas, sistema CO2/água, composição da fauna e flora séssil e metabolismo líquido em áreas recifais impactadas e não impactadas. O grupo têm atuado na avaliação ambiental e monitoramento de atividades de prospecção de gás e óleo na plataforma continental interna da Bacia de Camamu. Projetos envolvendo o sistema dióxido de carbono/água do mar estão em fase inicial, na Baía de Todos od Santos e plataforma continental do estado da Bahia.