O Grupo de Pesquisa de Biotecnologia Aplicada, originalmente denominado Biotecnologia Aplicada à Agropecuária, até 2009 atuou em três linhas de pesquisa, com repercussões que se seguem:Ciência e Tecnologia das Fermentações:Projeto financiado por órgão de fomento estadual, estudando identificação em nível molecular de microrganismos do rúmen envolvidos em biohidrogenação de lipídeos no rúmen, envolvendo alunos de especialização e co-orientação em programa de doutorado da USP e alunos de graduação (PIBIC). Genômica e BioinformáticaO Laboratório de Biologia Molecular Aplicada à Agropecuária esteve envolvido em pesquisa genômica (Laboratório de Sequenciamento do Projeto Genoma Brasileiro, Projeto Genoma do Paraná, e Rede Sul de Genomas), Genoma Funcional de Chromobacterium violaceum, e de bioinformática, sediando a Rede Paranaense de Bioinformática (BioNet), gerando publicações em revistas indexadas e orientação de alunos de especialização e graduação (PIBIC).Biotecnologia da Reprodução:Orientação de alunos de graduação (PIBIC/CNPq), publicações em periódicos indexados, trabalhos apresentados em eventos significativos da área.A partir de 2008, com a criação do Mestrado em Ciência Animal, seguido da criação do curso de Bacharelado em Biotecnologia pela PUCPR, seu escopo expandiu em função da colaboração de mais docentes pesquisadores, levando a reformulação das Linhas de Pesquisa.
