O grupo de Biofísica Computacional e Modelagem Molecular foi criado como parte do Programa de Computação Científica (PROCC) da Fundação Oswaldo Cruz no ano de 2002, com o ingresso do professor Dr. Ernesto Caffarena à instituição. Foi um dos pioneiros dentro da Fundação na área de metodologias computacionais, essencialmente a modelagem molecular, aplicada a projetos visando o estudo de alvos moleculares essenciais na busca de terapias mais eficientes para doenças negligenciadas, ampliando assim a abordagem de investigações tradicionalmente realizadas nesta instituição. Dentre os principais objetivos relacionados à pesquisa está o desenvolvimento e aplicação de métodos, técnicas e algoritmos computacionais nas áreas de desenho racional de fármacos e a análise da dinâmica de sistemas biológicos permitindo a melhor interpretação de dados estruturais e proposição de hipóteses a serem testadas experimentalmente.
