As pesquisas desenvolvidas pelo grupo visam o estudo da diversidade e da genética de microrganismos, com foco em fungos produtores de enzimas e compostos bioativos; fungos fitopatogênicos; microrganismos endofíticos e bactérias ambientais e patogênicas. Os fungos produtores de enzimas pertencem ao gênero Penicillium, com ênfase aos estudos da organização e regulação da expressão gênica visando a obtenção de linhagens com maior produção de pectinases. As linhagens melhoradas serão utilizadas na indústria têxtil, celulose e alimentos. O fungo fitopatogênico Colletotrichum lindemuthianum está sendo investigado para a identificação de genes envolvidos na interação hospedeiro-patógeno para estratégias de controle. Outros trabalhos envolvem a análise da diversidade de comunidades microbianas de amostras ambientais a partir de métodos independentes de cultivo, além de estudos envolvendo pequenos RNAs regulatórios na regulação da expressão gênica em bactérias patogênicas de animais.
