O estudo da Ecologia de Fitoplâncton e Microorganismos Marinhos teve início na FURG no ano de 1984 e atualmente conta com 4 professores, bolsistas, estudantes de graduação, mestrado e doutorado em Oceanografia Biológica e Aqüicultura. As linhas de pesquisa são relacionadas com a ecologia de procariontes e protistas planctônicos marinhos (fitoplâncton, protozooplâncton e bacterioplâncton) em ambientes costeiros e oceânicos do sul do Brasil: estuário da Lagoa dos Patos (ELP), praias adjacentes, plataforma continental e talude, e também no Oceano Atlântico Sul e Antárctica. Os resultados dos estudos fornecem a base para a detecção de mudanças de longo prazo. Destaca-se, o intercâmbio com pesquisadores de outras instituições brasileiras e internacionais, e até o presente, a formação de mais de 60 mestres e doutores, que hoje atuam profissionalmente em outras instituições no Brasil e exterior.
