O grupo Saneamento e hidrologia ambiental estuda a qualidade das águas de chuva, de águas superficiais, dos processos de transporte e da dispersão de poluentes no perfil do solo e ao nível da bacia hidrográfica, subsidiando o processo de gestão de recursos hídricos. Os pesquisadores do grupo têm aprovados projetos de pesquisas junto as agências de fomento (CNPq, FINEP, FAPESC, CAPES), em parceria com instituições de pesquisas nacionais e internacionais, com destaque para o Projeto "Fortalecimento dos Comitês de Bacias Hidrográficas do agrupamento Leste de Santa Catarina", financiado pela FAPESC, que visa apoiar o fortalecimento dos comitês de bacias hidrográficas e aos instrumentos de gestão de recursos hídricos do agrupamento Leste do Estado de Santa Catarina e o Efeitos a longo prazo da reciclagem de dejetos de animais no solo estudo do comportamento de Cu e Zn, de cooperação internacional, Programa CAPES-COFECUB.