O GEPEC atua principalmente no estudo de vertebrados em ecossistemas marinho-costeiros, incluindo lagoas costeiras, estuários, baías e plataforma continental interna, na costa do Estado do Rio de Janeiro. As atividades envolvidas nas linhas de pesquisa do GEPEC visam elucidar aspectos das interações ecológicas e ciclo de vida de peixes e outros vertebrados marinhos, incluindo tartarugas marinhas e cetáceos. O grupo ainda atua na caracterização da atividade pesqueira através de estudos de dinâmica populacional dos principais recursos explotados.