Em 1997, foi criado no Centro de Ciências Exatas da UNISINOS, um Grupo de Pesquisa Interdisciplinar, composto por quatro doutores das áreas de Matemática, Computação e Física, que identificaram temas de interesse comum entre suas áreas específicas de conhecimento. Ao final do mesmo ano, esse Grupo foi cadastrado no Diretório de Grupos de Pesquisa no Brasil do CNPq, com a denominação de Grupo de Modelagem Computacional com atuação e produção científica e tecnológica nas Linhas de Pesquisa de Física Matemática e de Modelagem de Sistemas de Manufatura Flexíveis. Este fato foi o ponto de partida para o início de vários projetos e a semente para a criação de um Programa de Pós-Graduação Interdisciplinar em Computação Aplicada, fato este que se concretizou em outubro de 1999 . Observou-se que os projetos de pesquisa gradualmente sofreram uma reorientação quanto ao seu escopo, passando a ser mais de caráter aplicativo e privilegiando a integração entre as áreas de conhecimento envolvidas. O Programa Interdisciplinar de Pós-graduação em Computação Aplicada é constituído pelo curso de Mestrado Acadêmico, que foi recomendado pela CAPES em maio de 2000, tendo, na última avaliação do triênio (2004-2006), recebido nota 4. O Programa tem como área de concentração Modelagem e Simulação e possui cinco Linhas de Pesquisa: Pesquisa Operacional, Inteligência Artificial, Computação Gráfica e Processamento de Imagens, Redes de Computadores e Sistemas Distribuídos e Engenharia de Software e Linguagems de Programação.Em, setembro de 2011 o Grupo foca suas atividades na Linha de Pesquisa de Pesquisa Operacional, continuando a ter colaboradores de outras linhas de pesquisa do PIPCA.
