Avaliação de risco de OGMs é na atualidade uma necessidade, já que inúmeros produtos estão sendo desenvolvidos, e deve ser avaliado o risco ao meio ambiente, a saúde animal e humana que estes organismos podem acarretar. Através das interações microbianas podemos utilizá-las na avaliação de risco ambiental através das suas alterações causadoas por um agente ou processo. Através destes mecanismos estamos obtendo novos produtos antibióticos para o controle de bactérias fitopatogências e de bactérias multi-resistentes hospitalares.