O grupo de Pesquisa Fundamentos e Estratégias Educacionais para o Ensino de Química e Biologia foi estruturado a partir da proposta do mestrado profissionalizante em Ensino de Ciências. O grupo encontra-se organizado em 3 linhas de pesquisa: Elementos e Metodologias no Ensino de Biologia (EMEB) e Elementos e Metodologias no Ensino de química (EMEQ) e a de Educação Ambiental. A linha EMEB desenvolve projetos a partir da criação do mestrado visando o desenvolvimento de pesquisas sobre ensino nos diferentes tópicos da Biologia. Oferece disciplinas no mestrado: Tópicos em Biologia, Tópicos atuais em Genética e Evolução e Tópicos avançados em Meio ambiente e desenvolvimento sustentável como disciplinas para a formação professores de Química e de Biologia.