O grupo de pesquisa em Métodos alternativos de controle de micro-organismos tem o objetivo de buscar novos métodos para o tratamento de doenças infecciosas. A motivação para essas pesquisas é o crescente aumento da resistência dos micro-organismos aos antibióticos, o que representa um grande desafio nas áreas médicas. As pesquisas estão focadas em fitoterapia e busca por novas moléculas antimicrobianas, aplicações do ozônio, jato de plasma frio de pressão atmosférica e novos materiais. O grupo tem característica multidisciplinar e congrega pesquisadores de várias áreas do conhecimento na busca por novas tecnologias.