O grupo de pesquisa em Sistemas agroflorestais: desenvolvimento sustentável e biodiversidade" tem como principal objetivo, estudar o ambiente físico, biótico abiótico e sócio-econômico de sistemas agroflorestais com diferentes combinações de estrutura. Tem como objetivos específicos estudar: as interações entre as espécies, produção e integração com a sociedade, em sistemas que visem a sustentabilidade do agroecossistema, bem como acompanhar as mudanças na biodiversidade. Espera-se com os resultados poder indicar a nível regional, alternativas com justificativas, para os produtores locais adotarem com confiança as técnicas mais sustentáveis.