O grupo de pesquisa Manejo integrado de doenças de plantas foi criado para fortalecer e incentivar o desenvolvimento de pesquisas na área de Fitopatologia junto a Universidade do Estado da Bahia voltado para a região do Oeste baiano onde predomina o bioma Cerrado. O grupo formado por pesquisadores de instituições públicas e privadas têm como objetivo desenvolver trabalhos em parceria voltados ao manejo integrado de doenças de diversas culturas através de métodos culturais, químicos e biológicos embasados em estudos epidemiológicos. Diversos trabalhos de pesquisa vem sendo desenvolvidos com aporte financeiro de instituições como a FAPESB,CNPq, do Instituto do Meio Ambiente da Bahia (IMA-BA), Fundo para o Desenvolvimento do Agronegócio do Algodão (FUNDEAGRO)e outras instituições privadas. Dentre esses trabalhos pode-se destacar os estudos epidemiológicos de doenças na cultura de oleaginosas como a mamona, o girassol e o pinhão manso, estudos na área de biotecnologia para o controle biológico de nematóides e fungos fitopatogênicos na cultura do algodão, da soja, café, frutíferas e outras, além de estudos sobre a Biodiversidade de fungos com potencial para controle biológico de patógenos de solo no cerrado baiano e estudos com micorrizas.
