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Suporte ao Desenvolvimento e à Composição de Serviços Web Semânticos para a Análise de Expressão Gênica
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Utilização de informações termodinâmicas e estruturais na predição de sítios potenciais de ligação de receptores nucleares ao DNA: uma abordagem computacional
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Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus
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Determinação pré-natal não invasiva de paternidade utilizando micro-haplótipos
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Canalização: fenótipos robustos como consequência de características da rede de regulação gênica.
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Uma abordagem para a indução de árvores de decisão voltada para dados de expressão gênica
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Integração de bases de dados administrativos com ferramentas genômicas
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Auto-organização da população em sistemas imunológicos artificiais aplicada ao docking de proteínas
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Explorando a Complexidade do Transcriptoma Humano: Eventos de Splicing Alternativo
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Seleção natural no vírus da hepatite C: influência do sistema imune na resposta ao tratamento.
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Analise da via de regulação gênica por ácido retinóico: uma abordagem por bioinformática e biologia estrutural
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Caracterização e modelagem da atividade eletrofisiológica em pacientes com epilepsia
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Análise in silico de regiões promotoras de genes de Xylella fastidiosa
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Identificação in-silico de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial
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Análise estatística na interpretação de imagens: microarranjos de dna e ressonância magnética funcional.
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Modelagem computacional de famílias de proteínas microbianas relevantes para a produção de bioenergia
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Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas
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Auxílio na prevenção de doenças crônicas por meio de mapeamento e relacionamento conceitual de informações em biomedicina.
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"Método de apoio à pesquisa e ao diagnóstico clínico na identificação de acometimento em diferentes tipos de fibras musculares por meio de imagens histopatológicas"
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Modelos Discretos para Sistemas de Sinalização Celular Baseados no Contato Célula-Célula
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Desenvolvimento de um algoritmo para identificação e caracterização de cavidades em regiões específicas de estruturas tridimensionais de proteínas.
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Data-intensive analysis of hiv mutations
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Técnicas para Análise do Crescimeto e Movimento de Células Neurais
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Simulation of biochemical systems using constraint-based methods and complex networks
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PREDIÇÃO COMPUTACIONAL DE SÍTIOS DE LIGAÇÃO DE FATORES DE TRANSCRIÇÃO BASEADA EM GRAMÁTICAS REGULARES ESTOCÁSTICAS
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Estudo de Técnicas de Processamento de Imagens para Análise Histológica Visando à Detecção e à Classificação Automática de Câncer de Colo de Útero.
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Structural Bioinformatic Studies of the Zika Virus NS1 Protein and its Molecular Interactions
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Uma arquitetura de question-answering instanciada no domínio de doenças crônicas
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Mineração de dados de anemia falciforme e priapismo
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Uma abordagem para a construção de uma única árvore a partir de uma Random Forest para a classificação de bases de expressão gênica
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Análise computacional do genoma e transcritoma de Plasmodium vivax: contribuições da Bioinformática para o estudo da malária
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Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações.
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Comparação de redes de regulação gênica da placenta em resposta à exposição ao estresse entre sexos
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Morfometria computacional de órgãos de frango de corte submetidos a duas dietas distintas: suplementação mineral quelada versus suplementação mineral tradicional.
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Identificação de transferência gênica horizontal em procariotos, estudo do regulon SOS de Caulobacter crescentus e análise estatística de colocalização de posições genômicas.
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Análise e reconhecimento digital de formas biológicas para o diagnóstico automático de parasitas do gênero Eimeria.
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Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias.
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Comparative genomics and the evolution of amphibian chemical defense
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Medidas de Fluxo de Informação com Aplicação em Neurociência
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Um Novo Modelo para Cálculo de Probabilidade de Paternidade - Concepção e Implementação.
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Um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de mesmo ramo evolutivo
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"Sifter-T: Um framework escalável para anotação filogenômica probabilística funcional de domínios protéicos"
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Identificação e anotação de RNAs longos não-codificantes em Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum
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Recuperação de MAGs de alta qualidade em dados metagenômicos tempo seriado e desenvolvimento de FixAME: uma ferramenta auxiliar de curadoria de erros de montagem genômica
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Análise computacional dos genomas de duas estirpes de Bradyrhizobium de importância econômica para o Brasil
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LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local
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Método para processamento e análise computacional de imagens histopatológicas visando apoiar o diagnóstico de câncer de colo de útero.
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Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classifcadores de RNAs codifcantes e não codifcantes
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Busca de variantes em sequência de DNA proveniente de pacientes com deficiência em processos de reparo do genoma
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GENÉTICA
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Genômica comparativa aplicada no estudo da invasividade de Streptococcus pyogenes
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Estudo da poliadenilação alternativa: efeito dos polimorfismos nos elementos em cis no RNA e de transcritos em antissenso
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Tracking arbovirus in sylvatic and urban environments
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Dinâmica da Fermentação Alcóolica: Aplicação de Redes Booleanas na Dinâmica de Expressão Gênica em Linhagens de Saccharomyces Cerevisiae durante o Processo Fermentativo
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Análise de Componentes Locais com Aplicações em Ressonância Magnética Funcional
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Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos
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Reconstrução da rede metabólica em escala genômica da bactéria Burkholderia sacchari
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Análise da Tetramerização da Proteína CD38 por meio de Docking Molecular
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Investigação de perfis microbianos humanos e sua relação com o câncer
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Seleção de modelos através de um teste de significância genuinamente bayesiano: Misturas de normais multivariadas e hipóteses separadas
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Sponge Microbiomes from Great Amazon Reef System
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Predição de função para TSSaRNAs (transcritos associados a sitios de início de transcrição) em Halobacterium salinarum NRC-1
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USP ( ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA LUIZ DE QUEIROZ )
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Desenvolvimento de umpipeline para identificar automaticamente os genes compostos predominantemente por microexons arranjados em tandem no genoma anotado de Schistosoma mansoni
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Composição microbiana do inóculo e do composto maduro no processo de compostagem do Zoológico de São Paulo avaliada por meio de metagenômica
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Inteligência Artificial aplicada na seleção de plantas medicinais do cerrado com atividades antimicrobianas
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BioNetStat: Uma ferramenta para análise diferencial de redes biológicas
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Investigações sobre os mecanismos moleculares da angiogênese com base em dados de expressão gênica num modelo murino, e sua aplicação no prognóstico do câncer de mama
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Estruturas de redes em ossos ao longo do desenvolvimento
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Análise do metaboloma e transcriptoma da cana-de-açúcar ao longo do ciclo de maturação da planta
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Representação paramétrica de famílias de redes booleanas que produzem ondas de propagação
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Exploração de parâmetros de modelos biológicos sob diferentes paradigmas estatísticos
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Transcriptoma, Sítios de Ligação para Fatores de Transcrição e Região Promotora de cana-de-açúcar"
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Bioinformática aplicada em RNomics: Estratégias Computacionais para Caracterização de RNAs Não-Codificadores
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Bioinformática aplicada à biologia sistêmica para a identificação dos fatores regulatórios do acúmulo de sacarose no colmo da cana-de-açúcar
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Análise computacional da diversidade viral presente na comunidade microbiana durante o processo de compostagem
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Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni.
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Machine Learning Prediction in Genomic Sequences of Prokaryotic Viruses from Metagenomic Datasets
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Plataforma Computacional de Integração de Dados Clínicos e Dados Biomoleculares para Suporte à Pesquisa em Oncogenômica
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Medidas de Fluxo de Informação com Apicação em Neurociência
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Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica.
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https://brcris.ibict.br/individual/publ_25c0ead3-9608-40b4-ae39-238b85c4e7dd
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label: Dinâmica da Fermentação Alcoólica: Aplicação de Redes Booleanas Probabilísticas Sensíveis a contexto na Dinâmica da Expressão Gênica na Linhagem Industrial PE-2 da Saccharomyces cerevisiae durante o Processo Fermentativo.
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Uso de técnicas de reconhecimento de padrões e polimorfismos de base única para predição de transtornos psiquiátricos da infância
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DESENVOLVIMENTO DE UM MODELO BIOFÍSICO PARA A DESCRIÇÃO DE MECANISMOS DE SINALIZAÇAO NO REPARO EM DNA A PARTIR DE EFEITOS QUANTO-COERENTES
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Uma abordagem de integração de dados de redes PPI e expressão gênica para priorizar genes relacionados a doenças complexas
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O transcritoma de retinopatia induzida por oxigênio e uma assinatura gênica prognóstica baseada em angiogênese para predição de recidiva de cancer de mama
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Métodos computacionais para a caracterização e análise da relação entre anatomia e expressão gênica em sistemas biológicos.
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"Bioinformática estrutural de proteínas modificadas por eventos de splicing alternativo"
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Integração de sistemas biológicos
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UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO
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Uso de Proveniência de Dados para Extração de Conhecimento em Sistemas de Informação de Hemoterapia
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Uso de Mapeamento Conceitual para Redução da Descontinuidade Semântica na Recuperação de Imagens Microscópicas de Carcinoma Tireoidiano
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Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV
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Descrição da proveniência de dados para extração de conhecimento em sistemas de informação de hemoterapia
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Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue: Insights Sobre Mecanismos de Regulação Gênica
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Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni.Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni
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Pipeline para detecção de Copy Number Variation (CNV) e sua caracterização na população brasileira
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Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático
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Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas
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Medidas de dependência entre séries temporais: estudo comparativo, análise estatística e aplicações em neurociências.
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Análise de expressão gênica de Haemophilus influenzae em processo fermentativo em biorreator
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Análise de transcriptomas de células de pacientes xeroderma pigmentosum após irradiação com luz UVA
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Predição computacional de alvos de microRNAs associados a fenótipos de interesse.
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Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas
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Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação gênica.
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"Métodos estatísticos para a análise de dados de cDNA microarray em um ambiente computacional integrado"
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Investigação sistêmica da regulação de transcritos codificadores de transposases pela chaperona SmAP1 em Halobacterium salinarum
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Reconstrução e análise de genomas de bactérias de compostagem a partir de dados metagenômicos
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Auto-Organização da População em Sistemas Imunológicos Artificiais
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Análise do transcritoma do mexilhão marrom (Perna perna) sob contaminação por antraceno
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Análise transcritômica de macacos Rhesus durante infecção aguda por Zika Vírus
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"Troost - Busca de interações entre trios de SNPs em estudos de associação de genoma inteiro"
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Predição de RNAs não codificantes e sua aplicação na busca do componente RNA da telomerase.
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Cadeias estocásticas parcimoniosas com aplicações à classificação e filogenia das seqüências de proteínas.
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Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais
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Indentificação in silico de nRNAs no organismo modelo halobacterium salinarum
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Uma abordagem integrativa usando dados de interação proteína-proteína e estudos genéticos para priorizar genes e funções biológicas em transtorno de déficit de atenção e hiperatividade
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A IMUNIDADE INATA NO INDIVÍDUO IDOSO: FATORES PREDISPONENTES PARA SEPSE E OUTRAS DOENÇAS COMPLEXAS
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Seleção de modelos através de um teste de hipótese genuinamente bayesiano: misturas de normais multivariadas e hipóteses separadas.
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Caracterização in silico de transcritos intrônicos humanos e de camundongo
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Integração de dados na inferência de redes de genes: avaliação de informações biológicas e características topológicas
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Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno.
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Aplicação de métodos computacionais e estatísticos para o estudo da cis-regulação da expressão gênica
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Uso de estratégias baseadas em conhecimento para algoritmos genéticos aplicados à predição de estruturas tridimensionais de proteínas.
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Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação específica com cepas de Pseudomonas aeruginos
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Modelagem matemática-computacional da conectividade cerebral em ressonância magnética funcional para o estudo do estado de repouso.
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"Busca guiada de patentes de Bioinformática"
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Estudo da poliadenilação alternativa, influência dos elementos em cis e antisense
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Modelagem Coarse-Grained dos Fenômenos de Complexação de Proteinas
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DESENVOLVIMENTO DE UMA FERRAMENTA DE BIOINFORMÁTICA PARA INTEGRAÇÃO DAS ESCALAS DE TRANSCRIÇÃO GÊNICA, PROTEÔMICA E FISIOLOGIA UTILIZANDO SORGO E CANA-DE-AÇÚCAR COMO SISTEMAS MODELOS
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Caravela: um navegador para metagenomas
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Desenvolvimento de um pipeline para análise genômica de metilação do DNA
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Redes neurais residuais profundas e autômatos celulares como modelos para predição que fornecem informação sobre a formação de estrutruas secundárias proteicas
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Métodos estatísticos para a análise de bibliotecas digitais de expressão gênica.
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Redes Filogenômicas e Transferência Lateral de Genes
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Herdabilidade e e Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de Atividade Física Autorreportada - uma investigação de famílias brasileiras
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Origem de genes recentes, uma abordagem com PSSMs deterioradas e arquiteturas de domínio proteico
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A transcrição pervasiva na archaea Halobacterium salinarum NRC-1 e a identificação de novos transcritos
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Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs
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Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes
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