Human pathogens are usually very skilled in acquiring and recombining genetic information, providing new mechanisms that allow the adaptation to different niches, hosts and to the most advanced antibiotic therapies. The increasing antibiotic resistance among human pathogens has translated into a significant economic and logistic impact to healthcare systems and society. Considering the paucity of therapies that still remain active against several pathogens, vaccination appears as a strategic alternative to reduce the burden of infections.During the last ten years, vaccinology has drastically evolved in order to keep the pace with the evolving mechanisms of bacterial defence and pathogenesis. In this scenario, Danilo has played a striking role in the development and application of cutting-edge and innovative strategies on vaccine research. Bachelor in Industrial Pharmacy (UFPR, 1999) and Master in Pharmaceutical Sciences (UFPR, 2004), Danilo is an expert in reverse vaccinology, a vaccinology approach born right after the sequencing of the first bacterial genomes, focused on the mining of genomic information for the identification of potential vaccine candidates against concerning human pathogens.During his PhD (Novartis Vaccines and Università degli Studi di Siena, 2008), under the supervision of Dr Rino Rappuoli and Dr Mariagrazia Pizza, Danilo contributed to the development of a new reverse vaccinology strategy, the subtractive approach, to suit a ubiquitous pathogen able to cause infection in different niches and hosts, Escherichia coli. It consisted in a genomic comparison between pathogenic and non-pathogenic strains for the identification of targets directly associated to the interaction with the human host, leading to the selection of highly prevalent and broadly protective vaccine candidates. In collaboration with Prof. Richard Moxon from the University of Oxford, Danilo also contributed to the design of an innovative strategy, the pan genome approach, to identify new candidates against non-typeable Haemophilus influenzae (NTHi), a major cause of otitis media. Considering the high variability of NTHi strains, this approach consisted in the identification of novel targets taking into account their prevalence in a collection of worldwide clinically relevant strains.During his current appointment at the University of Queensland and Australian Infectious Diseases Research Centre, the reverse vaccinology and proteomic approaches were combined for the first time for the identification of surface-associated and secreted antigens against Acinetobacter baumannii, an emerging cause of endemic and epidemic nosocomial infections in intensive care units. Overall, these innovative approaches led to the identification of novel and uncharacterised bacterial antigens and allowed me to make a remarkable contribution to the functional, structural characterisation and regulation of novel mechanisms of pathogenesis.Therefore Danilo has the skills and the background required to support and lead innovative and interdisciplinary projects to unveil and understand the mechanisms associated to infection and to deliver broadly protective vaccines against clinically relevant human pathogens.
Uma das maiores habilidades dos patógenos humanos é a capacidade de adquirir e recombinar informações genéticas, criando novos mecanismos que permitam a adaptação a novos nichos, hospedeiros e aos mais avançados tratamentos. O aumento da resistência bacteriana entre os patógenos humanos tem se transformado em um significativo impacto econômico e logístico nos sistemas de saúde públicos e na sociedade. Considerando a contínua diminuição no número de terapias ainda eficazes contra muitos patógenos, a vacinação se apresenta como uma alternativa estratégica no controle destas infecções.Nos últimos dez anos, a vacinologia tem evoluído drasticamente para acompanhar a rápida evolução dos mecanismos de defesa e patogênese bacteriana. Neste contexto, Danilo tem executado um papel fundamental no desenvolvimento e aplicação de estratégias avançadas e inovadoras na pesquisa de novas vacinas. Com formação em Farmácia Industrial (UFPR, 1999) e mestrado em Ciências Farmacêuticas (UFPR, 2004), Danilo é um experto em reverse vaccinology , um approach nascido logo após o sequenciamento dos primeiros genomas bacterianos e dedicado à tradução de informações genômicas em vacinas eficazes.Durante seu doutorado (Università degli Studi di Siena e Novartis Vaccines, 2008), sob a supervisão do Dr. Rino Rappuoli e Dra. Mariagrazia Pizza, Danilo participou no desenvolvimento de uma nova estratégia de reverse vaccinology , chamada subtractive approach , criada nos moldes da Escherichia coli, um microrganismo onipresente capaz de causar infecções em diversos nichos e hospedeiros. Essa estratégia consistia na comparação genômica entre cepas patogênicas e comensais, permitindo a identificação de candidatos diretamente associados à interação com o hospedeiro e evitando impactos na flora comensal. Sucessivamente, em colaboração com o Prof. Richard Moxon da University of Oxford, Danilo também contribuiu no design de uma nova estratégia, chamada pan genome approach , para identificar novos candidatos contra Haemophilus influenzae não-tipável (NTHi), um dos maiores causadores de otite média. Considerando a alta variabilidade das cepas de NTHi, este método consistia na identificação de novos candidatos considerando sua prevalência em uma coleção de cepas clínicas de relevância mundial.Nos dois últimos anos como pesquisador da University of Queensland e Australian Infectious Diseases Research Centre, a reverse vaccinology tem sido combinada a métodos proteômicos pela primeira vez para a identificação de antígenos expostos na superfície ou secretos por Acinetobacter baumannii, uma causa emergente de infecções hospitalares em unidades de tratamento intensivo. De uma forma geral, esses métodos inovadores têm contribuído ao desenvolvimento de novas vacinas e consequentemente proporcionado uma grande contribuição na caracterização funcional, estrutural e regulação de novos mecanismos de patogênese microbiana.Desta forma, Danilo tem as habilidades e conhecimentos necessários para apoiar e liderar projetos inovadores e multidisciplinares na tentativa de descobrir e entender os mecanismos associados a infecções e produzir vacinas eficazes contra patógenos clinicamente relevantes.
