Bioinformatica Conceito

área de pesquisa

• CRISPRloci: comprehensive and accurate annotation of CRISPR-Cas systems
• ?REDE NEURAL CONVOLUCIONAL NA INFECÇÃO POR HELICOBACTER PYLORI?
• A cost-effective approach to DNA methylation detection by Methyl Sensitive DArT sequencing
• A expressão diferencial de genes e elementos de transposição entre testículos e ovários de híbridos de Drosophila mojavensis e D. arizonae está associada ao isolamento reprodutivo pós-zigótico?
• A novel approach for de Bruijn Graph construction for denovo genome assembly
• Activité d'éléments transposables dans les populations de Drosophila mojavensis et D. arizonae et chez leurs hybrides
• Alan Mitchell Durham
• Alessandra Pavan Lamarca da Silva
• Alexandre de Sousa Mendes
• Aline Maria da Silva
• Alinne Pereira de Castro
• Analise Filogenética do Sistema de dois componentes NtrY/NtrX
• Analysis, design and implementation of improved queries on integrated biological databases
• Anne Cybelle Pinto Gomide
• Anotação e caracterização de elementos de transposição no genoma de Drosophila mojavensis e de sua espécie irmã D. arizonae
• Análise Computacional da Variação do Potencial Metabólico Microbiano em Metagenomas
• ANÁLISE DA EXPRESSÃO DE MICRORNAS POR SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇÃO NO ADENOCARCINOMA GÁSTRICO
• Análise da expressão gênica em Schistosoma mansoni induzida pelo pareamento sexual e pelo sexo do hospedeiro através da técnica dos microarranjos de DNA.
• Análise das linhagens de Saccharomyces cerevisiae expostas ao estresse por etanol.
• Análise de Diversidade em Coffea utilizando retrotransposons Ativos como marcadores moleculares
• Análise de elementos formadores de Z DNA no genoma de células Humanas
• ANÁLISE DE VARIANTES DO GENE CDH1 NO BANCO DE DADOS 1,000 GENOMES: Desenvolvimento de uma ferramenta para análise de distribuição das mutações
• Análise estrutural da dipeptidil peptidase-4 (DPP-4) e estudos das interações com ligantes bioativos
• Análise in silico de regiões promotoras de genes de Xylella fastidiosa
• Análise transcricional comparativa entre linhagens de Anticarsia gemmatalis resistentes e suscetíveis a toxina Cry1Ac de Bacillus thuringiensis
• Aplicação de aprendizado de máquina para posicionamento taxonômico de bactérias baseado em ensaios bioquímicos e fisiológicos
• ASSESSMENT OF THE EFFECT OF DIFFERENT BIOREMEDIATION APPROACHES ONTHE SOIL MICROBIOME OF BIOFUEL-AFFECTED AREAS
• Avaliação da expressão gênica diferencial entre folhas e tecidos vasculares de Eucalyptus grandis.
• Avaliação In Sílico do efeito das mutações nos genes HBB e CFTR em individuos depositados no 1000 genomes database
• Bacterial diversity changes in agricultural soils influenced by poultry litter fertilization
• Baixa conservação do conteúdo gênico do cromossomo Y em 12 espécies de Drosophila.
• Before and after AlphaFold2: An overview of protein structure prediction
• BioBI - Ferramenta para análise de dados biológicos
• BioSOM: Metodologia para identificação de sinônimos de genes utilizando Self-Organizing Maps.
• Blaise Li
• Bruna Franciele Faria
• Bruna Maria Castro Salomão Quaresma
• BRUNO SIEGEL GUERRA
• Caio Ambrósio Leal Dutra
• Camila Farias Amorim
• Camila Tauane Monteiro do Nascimento
• CARACTERIZAÇÃO DE PROTEÍNAS RELACIONADAS A SEMENTES E IDENTIFICAÇÃO DE MICROSSATÉLITES ATRAVÉS DA BIOINFORMÁTICA
• Caracterização e análise evolutiva do elemento Vege, uma família de MITE em espécies de Drosophila.
• CARACTERIZAÇÃO in silico DAS VARIANTES DE 17 GENES RELACIONADOS ÁS SINDROMES DE CÂNCER HEREDITÁRIO
• Carlos Cristiano Hasenclever Borges
• Carolina Angelica da Silva Parada
• Cauã Antunes Westmann
• Changes in bacterial diversity of activated sludge exposed to titanium dioxide nanoparticles
• Characterization and heterologous expression of a serine carboxypeptidase from digestive fluid of Nepenthes mirabilis carnivorous plant for hydrolyzing the cow´s milk proteins
• Complexo MSP2 de Anaplasma marginale: Peptideos Sinteticos e Predicao Computacional. Uma nova proposta.
• Composição microbiana do inóculo e do composto maduro no processo de compostagem do Zoológico de São Paulo avaliada por meio de metagenômica
• Computational Footprinting Methods for Next-Generation Sequencing Experiments
• CONSOLIDAÇÃO DE PREDITORES DE PATOGENICIDADES COM TÉCNICAS DE INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL: APLICAÇÕES PARA ANÁLISE DE VARIANTES CLÍNICAS ́.
• Cristian Andres Chaparro Egana
• César Armando Beltrán Castañón
• César Manuel Vargas Benítez
• César Raimundo Lima Costa Júnior
• Daniel Evelio Milian Lorenzo
• Daniel Pascoalino Pinheiro
• Danilo Gomes Moriel
• Denise Rejane de Carvalho e Silva
• Deregulation of genes and transposable elements and hybrid incompatibility between Drosophila mojavensis subspecies and D. arizonae
• Desarrollo de Métodos de Cálculo de Difusión para Reactores Nucleares.
• DESCOBERTA E ANÁLISE DA VARIABILIDADE INTERESPECÍFICA DE PEQUENOS RNAS VIA SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇÃO EM EUCALYPTUS
• Desenvolvimento de pipelines para análises de ESTs, bibliotecas 16S e ITS para estudos genômicos em formigas Attini
• Desenvolvimento e validação de protocolos para a anotação automática de sequências ORESTES de Eimeria spp. de galinha doméstica.
• Desregulação de genes e elementos de transposição e incompatibilidade híbrida entre subespécies de Drosophila mojavensis e D. arizonae
• Dino Rogério Coinete Franklin
• Dinâmica evolutiva de elementos de transposição em Rhodnius robustus
• Discovering Selected Antibodies From Deep-Sequenced Phage-Display Antibody Library Using ATTILA
• Edgar Andrés Ochoa Cruz
• Eduardo Jordao Neves
• Eduardo Nogueira Cunha
• Edwin Rafael Villanueva Talavera
• Efeito da disponibilidade de água na composição e função de comunidades microbianas presentes no solo do Cerrado revelado por análises metagenômicas.
• Elementos de transposição como fonte de novidades genéticas em nível transcricional: uma abordagem computacional e molecular. Bolsista FAPESP
• Emilio Fernando Merino
• Erico Souza Teixeira
• Estudo de características evolutivas e polimórficas dos retrovírus endógenos
• Estudo de expressão gênica em citros utilizando modelos lineares
• Estudo de Variações Estruturais e de Sequência em Genomas Tumorais para Identificação de Biomarcadores e Novos Alvos Terapêuticos
• Everton Paschoal Antoniel
• Evolution of meiotic genes in Brassica; a stage to better master recombination
• Evolução funcional das duplicatas gênicas unc-4 e OdsH em Drosophila
• EXPRESSÃO DIFERENCIAL DE GENES E SEUS REGULADORES MICRORNAS, EM AMOSTRAS DE CÂNCER GÁSTRICO
• Expressão Global de piRNAs em Linhagens Celulares de Câncer Gástrico
• Fabricio Almeida Araujo
• Filipe de Carvalho Victória
• Filodinâmica e Evolução Molecular do Vírus da Dengue
• Filogenomica e Evoluçao de Helmintos
• Flavia de Carvalho Parra
• Fluxo para modelagem, avaliação, alteração e seleção de estruturas de proteínas
• Frida Mesel Casanova
• G-FINISHER: Uma nova estratégia para refinar e finalizar montagens de genomas bacterianos
• Gabriel Massaine Moulatlet
• Gabriella do Vale Pereira
• GCSplit
• GeneNetVirus um framework para o processamento e análise de Interações gênicas
• Genes colocalizados: estudo de mútua regulação de biogênese entre genes codificadores e não codificadores
• GeNNet: Uma abordagem automatizada na análise, reconstrução e gerenciamento de redes de interações gênicas utilizando dados longitudinais de transcriptomas de hospedeiros do SIV
• Gramaticas estoc[asticas livres de contexto em Plasmodium
• Gustavo Pelicioli Riboldi
• HERBERT RAUSCH FERNANDES
• Histone Methyltransferases Useful in Gastric Cancer Research
• História evolutiva da Mo-nitrogenase em Archaea e Bacteria descrita por modela vetorial.
• HIV-1 subtype AG in the italian MSM: the glass half full or half empty?
• Homology-Free Detection of Transposable Elements Unveils Their Dynamics in Three Ecologically Distinct Rhodnius Species
• Identification of potential inhibitors of Schistosoma mansoni purine nucleoside phosphorylase from neolignan compounds using molecular modelling approaches
• IDENTIFICAÇÃO E ANÁLISE IN SILICO DE LECTINAS NO PEIXE PULMONADO SUL-AMERICANO (Lepidosiren paradoxa) BASEADO EM TRANSCRIPTOMAS
• Identificação in silico de enzimas iso-funcionais não homólogas no complexo da interação planta vs fitopatógeno
• Identificação in-silico de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial
• Improved MeSH analysis software tools for farm animals
• In silico prediction and expression profile analysis of small non-coding RNAs in Herbaspirillum seropedicae SmR1
• Investigação de elementos de transposição em populações de Drosophila mojavensis e D. arizonae e seus híbridos
• Is Rickettsia amblyommii able to regulate long non-coding RNA expression in Amblyomma sculptum tick? An in silico approach.
• J TRIMMER
• Jerônimo Lameira Silva
• Joao Paulo Fumio Whitaker Kitajima
• Joel Amaque da Silva Indi
• Jorge Estefano Santana de Souza
• José Pedro Fonseca
• José Reynaldo Walther de Almeida
• João Luiz de Almeida Filho
• João Vitor Maldonado dos Santos
• Juliana José
• Juliana Silva Bernardes
• Julliane Dutra Medeiros
• Kellen Christina Malheiros Borges
• Kelly Johanna Hidalgo Martinez
• Kuruvilla Joseph Abraham
• Larissa Fernandes Leijôto
• Lauana Fogaça de Almeida
• Leonardo Rippel Salgado
• Lilian Vanussa Madruga de Tunes
• Luciane Vieira de Mello Rigden
• Luis Fernando Encinas Ponce
• Luiz Fernando Wurdig Roesch
• Luís Fernando Saraiva Macedo Timmers
• Luís Filipe Das Neves Cunha
• Lílian Hiromi Tomonari Yamasaki
• M?todos estat?sticos na an?lise de experimentos de microarray
• Marcel Pinheiro Caraciolo
• Marcela Mendes Salazar
• Marcelo Bertalan Quintanilha dos Santos
• Marcelo Colika Bassalo
• Marco Túlio Alves da Silva
• Marcus Bustamante Smolka
• Maribel Hernández Rosales
• Marlon Dias Mariano dos Santos
• Marta Giovanetti
• Mauricio Antonio Ferste
• Metodologia de análise de sequências genômicas baseada em padrões de entropia, coeficiente de clusterização e periodicidade
• Michael Waisberg
• MicroRNAs de semente de soja madura e em germinação e transferRNA-derived fragments (tRFs) associados a proteínas argonauta de Arabidopsis
• Miguel Angel Chávez Fumagalli
• Milene Ferro
• miRNOMA DO CÂNCER COLORRETAL: BIOMARCADORES DE RECIDIVAS E METASTASES
• Modelagem computacional das proteínas Hsero_0935, Hsero_1880, Hsero_2698, Hsero_2855 e Hsero_2872 de Herbaspirillum seropedicae Smr1 utilizando o servidor I-Tasser
• Modelo de Dados para um Pipeline de Sequenciamento de Alto Desempenho Transcritômico
• Montagem de novo e análise do transcritoma de Hevea brasiliensis por RNA-seq e screening por marcadores moleculares
• Natanja Sara Kirschbaum Slager
• Nathalia Baptista Dias
• O elemento transponivel Helena em Drosophila
• Oncogenômica: MicroRNAs no Câncer Gástrico.
• Os elementos de transposição NLTR BS e Helena estão associados a eventos de transferência horizontal em Drosofilídeos?
• Pablo Alberto Moscato
• Patricia Andressa de Almeida Buranello
• Patricia Lorena Gonzalez Grande
• Patterns of DNA methylation changes in elite Eucalyptus clones across contrasting environments
• Paula Regina Kuser Falcão
• Pedro Alexandre Favoretto Galante
• Phage-derived peptides as new epitopes of breast cancer
• Pierre Faux
• Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos
• Predição em sequências de vírus de procariotos através da aplicação de técnicas de aprendizado de máquina em dados metagenômicos
• Rachel dos Santos Soler Fonseca
• Raquel Enma Hurtado Castillo
• Recent Advances in the Prediction of Pharmacokinetics Properties in Drug Design Studies: A Review
• Reconstrução in silico da Rede Metabólica de Sesquiterpenos da Copaifera multijuga Hayne.
• Ressequenciamento de genomas de cultivares brasileiras de soja : análise estrutural e associativa
• Rigel: Plataforma em nuvem para aplicações biológicas de alto desempenho
• Rita Rebollo Figueiredo da Silva
• RNAs NÃO CODIFICADORES EM Herbaspirillum spp.
• RNAs não codificadores regulatórios em bactérias do gênero Aeromonas
• Rogério Fernandes de Souza
• Ruben Cruz Huacarpuma
• Sabrina Fonseca Ingênito Moreira Dantas
• Saloê Bispo Poubel
• Sandra Esmeralda DOS SANTOS
• Silvia Naomi Soída Hirayama
• SiMCaPe - Sistema para a montagem de cariótipo de peixe baseado em conjuntos difusos
• Sinalização molecular e celular
• SISTEMA CONEXIONISTA BASEADO EM AVALIAÇÃO GERIÁTRICA AMPLA PARA AUXÍLIO AO DIAGNÓSTICO DE DECLÍNIO COGNITIVO
• Sistema Evolutivo Eficiente para Aprendizagem Estrutural de Redes Bayesianas
• STATISTICAL MODEL CHECKING NO REPOSICIONAMENTO DE FÁRMACOS NA DOENÇA DE ALZHEIMER
• SUBTIPOS MOLECULARES DO CÂNCER DE MAMA PARA CLASSIFICAÇÃO DE PACIENTES DE ACORDO COM A SENSIBILIDADE QUIMIOTERÁPICA NEOADJUVANTE
• Sávio Torres de Farias
• Tais Caroline Silva
• Taran Grant
• Taylla Michelle de Oliveira Flores
• The importance of good practices and false hits for QSAR-driven virtual screening real application: a SARS-CoV- 2 main protease (Mpro) case study
• Transcriptoma da glândula venenífera da serpente Bothrops neuwiedi: montagem, anotação e identificação de proteínas de interesse farmacológico
• Transcriptoma do camarão branco do pacífico (Litopenaeus vannamei): montagem de novo e suas aplicações
• Tsang Ing Ren
• Turchetto-Zolet, Andreia C.
• UM PIPELINE DE SIMULAÇÃO DE DADOS DE EXPERIMENTOS DE MAPPING BY SEQUENCING EM ARABIDOPSIS THALIANA
• Uma abordagem de metodos computacionais para simulação de processos biologicos : simulação tridimensional e metabolica do desenvolvimento tumoral
• Uso de técnicas computacionais no estudo da transcrição e regulação gênica em Homo sapiens e Mus musculus
• Utilização de metodologias para análise comparativa de sequências nucleotídicas de um gene relacionado ao câncer de pele
• Valdir Ferreira de Paula Junior
• VALIDAÇÃO DE sRNAS E PREDIÇÃO DE REDES DE INTERAÇÃO sRNA/mRNA EM Herbaspirillum seropedicae SmR1
• Vasiliki Lagou
• vHULK, a New Tool for Bacteriophage Host Prediction Based on Annotated Genomic Features and Neural Networks
• Victor Luiz Bezerra Araujo da Silva
• Vinícius Jardim Carvalho
• Vitor Cirilo Araujo Santos
• Vladimir Barbosa Carlos de Souza
• Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira
• Wallace Ribeiro Nunes Neto
• Walter Felix Franco Neto
• Whole Genome Comparison using a Multithreaded Parallel Implementation
• Yesid Cuesta Astroz