Paulo possui graduação em engenharia pela PUC-Rio; mestrado em biologia celular e molecular (2006) pelo Instituto Oswaldo Cruz (CAPES 7), Fiocruz; doutorado pelo programa de engenharia de sistemas em computação (2010) COPPE / UFRJ (CAPES 7) com período sanduíche no Scripps Research Institute, Califórnia, sob supervisão do Dr. John R Yates, III (índice H: 196). Paulo é integrante do quadro permanente de docentes da pós-graduação em Biociências e Biotecnologia do ICC-Fiocruz, investigador associado honorário do Institut Pasteur, Montevideo e também orientou pelo Instituto de Química da UFRJ e pelo Programa de Engenharia de Sistemas e Computação da COPPE / UFRJ (CAPES 7). Paulo possui dois depósitos de patente, mais de 130 artigos publicados com destaques para: primeira ou última autoria na Nature Methods, Nature Protocols, Bioinformatics, entre outros. Paulo foi pesquisador de produtividade do CNPq nível 2 (comitê ciência da computação) durante 2 períodos e atualmente é pesquisador de produtividade pelo CA da Biofísica. Quanto às premiações, merecem destaque: Google Award for Academic Excellence, menção honrosa no prêmio CAPES tese de doutorado (2012), outra menção honrosa no Prêmio Capes tese (2016) em conjunto com o aluno que orientou (Diogo Borges Lima) premiação na categoria Inovação / patente pelo Laboratório Fleury na temática Inteligência Artificial voltada ao diagnóstico (2018). e Vichy Exposome Award (2022). A sua premiação de maior destaque foi em Dezembro de 2019, o Institut Pasteur Talent Award, onde foi agraciado entre os pesquisadores de 33 países, pertencentes à rede Fiocruz-Pasteur-USP, como sendo o pesquisador de destaque pela trajetória da carreira científica. Paulo atuou como membro do features panel do periódico Analitical Chemistry e atua como editor executivo do Journal of Proteomics da Elsevier, um dos periódicos mais prestigiados de sua área de atuação, desde 2014. Paulo já formou 9 mestres, 8 doutores e atuou como supervisor de pós-doutorado; atualmente orienta 7 alunos de pós-graduação, organiza e coordena eventos e cursos de âmbito internacional (Uruguai, Portugal), ministra palestras em encontros internacionais (Brasil, França, Portugal, Estados Unidos) e participa de diversas comissões. Paulo atua como coordenador de diversos grants nacionais e internacionais fomentados pelo CNPq, Fiocruz, Institut Pasteur, e até com empresas nacionais e internacionais como o Grupo Boticário, Vichy, Microsoft Research, e Nitto Avecia. A partir de agosto de 2018, Paulo criou, juntamente com Tatiana Brasil, o Laboratório de Proteômica Estrutural e Computacional na Fiocruz Paraná.
