Raphael Vinicius Rodrigues Dias

Degree in Biological Physics from São Paulo State University Júlio de Mesquita Filho (2015). I completed my Master's degree in Molecular Biophysics (2018) and Ph.D. in Molecular Biophysics (2023) at São Paulo State University - IBILCE. I have experience in the fields of Molecular Biophysics, Structural Molecular Biology, and Computational Biological Physics, with a focus on investigating protein mechanisms. My work primarily involves studying protein conformational changes, interactions with small molecules and peptides, and post-translational modifications such as glycosylations and phosphorylations. The techniques I use include molecular docking, molecular dynamics (both traditional and simplified models), comparative molecular modeling and threading (sequence alignment, homology, and folding recognition bioinformatics). I have extensive programming experience in the following languages: Bash, Fortran, Perl, and Python.

Possui graduação em Física Biológica pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (2015). Mestrado em Biofísica Moleular (2018) e Doutorado em Biofísica Molecular (2023) pela Universidade Estadual Paulista - IBILCE. Tem experiencia nas áreas de Biofísica Molecular, Biologia Molecular Estrutural e Física Biológica Computacional com ênfase na investigação de mecanismos proteicos, atuando principalmente em problemas de mudanças conformacionais de proteínas, interações com pequenas moléculas e peptideos e mudanças pós traducionais como glicosilações e fosforilações. Dentre as técnicas utilizadas, destaca-se o docking molecular, dinâmica molecular (modelos tradicionais e modelos simplificados) e modelagem molecular comparativa e threding (bioinformatica de alinhamento de sequências, homologia e folding recogntion). Ampla experiencia em programação ressaltando-se as linguagens em bash, fortran, perl e python.