Estudam-se problemas teorico-computacionais fundamentais em Biofísica Molecular relacionados com as proteínas, ácidos nucléicos, açúcares e membranas. Especificamente, aspectos como o enovelamento proteíco, estrutura de peptídeos, estatística e dinâmica do DNA, interação ligante-receptor, conformação de açúcares em solução, distribuição iônica e aglomerados moleculares são abordados. Procurando entender estes problemas são usadas técnicas computacionais, tais como, Monte Carlo e dinâmica molecular, bem como uso e desenvolvimento de ferramentas teóricas, como o operador integral de transferência, critérios para localização de energia (sistemas dinâmicos), aplicação e resolução de equações diferenciais, tipo de Poisson-Boltzmann, de Schrodinger e de Fokker-Planck.