O Departamento de Estatística da UFRN, que em 1997 contava apenas com um professor doutor no seu quadro, decidiu estimular a qualificação do seu quadro docente. Seguindo o seu plano de metas, dez docentes começaram seus estudos de doutoramento, no período de 1998 a 2001, em instituições como: IME-USP, POLI-USP, ESALQ-USP, UFMG, Iowa State University (EUA) e University of Wisconsin-Madison (EUA). Como uma consequência natural desta política de capacitação, surgiu um ambiente propício à criação de uma nova base de pesquisa, que promovesse a integração dos pesquisadores com interesses voltados ao desenvolvimento de métodos estatísticos. A BME teve como objetivo inicial o desenvolvimento de métodos estatísticos visando alcançar bons níveis de produção científica e melhoria do nível do curso de graduação em Estatística. Finalmente, após 2 anos de existência, esta base serviu de alicerce para a criação, em 2006, do programa de pós-graduação em Matemática Aplicada e Estatística.