A linha compreende pesquisadores com formações distintas e complementares, e vêm trabalhando em Biodiversidade, Metagenômica, Resistência aos Antimicrobianos e Monitoramento de Patógenos. Contribuímos com a publicação de artigos científicos e com a implementação da Coleção de Culturas de Vigilância em Saúde Única, com cerca de 3000 bactérias disponíveis à comunidade científica. Atualmente, realizamos a investigação do resistoma microbiano em ambientes aquáticos pelo NGS e no monitoramento de doenças infecciosas pela epidemiologia baseada em águas residuais, (SARS-CoV-2 e genes de resistência), dentro da abordagem da Saúde Única. Participamos de projetos envolvendo a o resistoma microbiano e a pesquisa de SARS-CoV-2 em águas residuais, como: ¿O uso da azitromicina durante a pandemia de Covid-19: Implicações na Resistência Antimicrobiana (Faperj); ¿Monitoramento metagenômico de Sars-CoV-2 em efluentes domésticos e hospitalares no Rio de Janeiro¿ (INOVA/Fiocruz), entre outros.