A produção da maioria das plantas cultivadas sofre perdas por infecções, e nem sempre genes de resistência estão presentes ou expressos, muito menos os métodos químicos de controle são eficientes e/ou saudáveis ao ambiente e demais espécies. São também escassas as informações sobre a qualidade e efeitos terapêuticos de produtos agropecuários e alimentícios em geral do Estado de Alagoas. Este grupo estuda estratégias bioquímico-moleculares de identificação de infecção e defesa nos patossistemas, análise dos parâmetros microbiológicos, físico-químicos e terapêuticos de produtos alimentícios (apícolas, farináceos, pescados, laticínios, leite humano, etc), a conversão microbiológica de resíduos agrícolas, urbanos e industriais, e a análise de qualidade atmosférica, de rios e efluentes, fornecendo alternativas ecoeficientes de tratamento e monitoramento constante da sua qualidade.