Este grupo pretende consolidar e expandir parte das atividades de pesquisa científica do JBRJ.Para tal estamos desenvolvendo e coordenando projetos tais como o Programa de Pesquisas em Biodiversidade da Mata Atlântica (PPBio Mata Atlântica) desenvolvido em cooperação com o MMA/PROBIO II/ MCT/UFRJ e Projetos em Ecologia e Restauração ecológica na Bacia do Rio São João-RJ com ênfase na Reserva Biológica Poço das Antas, e no Município do Rio de JaneiroTemos inserção também no Nucleo de Tecnologias para Restauração Ecológica (NUTRE) liderado pela UFRJ /Cempes/BR.