O grupo de pesquisas em águas residuárias e impactos ambientais desenvolve projetos de implantação, avaliação, monitoramento e divulgação, em escala de demonstração, de tecnologias acabadas de tratamentos de esgotos e métodos de reutilização desses esgotos como água de irrigação na agricultura. Destaca-se a avaliação da qualidade do lodo biológico gerado no tratamento e outros compostos oriundos de resíduos sólidos urbanos e rurais, como a torta da mamona e estercos como insumo agrícola e seus impactos na produção agrícola, no ambiente edáfico e nas águas lixiviadas e do lençol freático. Outra atividade desenvolvida é avaliação do deslocamento dos solutos presentes nas águas resiuárias, no solo, em que está sendo aplicada.