O Grupo de Pesquisa em Ecologia Aquática, vinculado ao Programa de Pós-Graduação em Zoologia (nota 5), destina-se ao estudo de aspectos relevantes da biologia de espécies dominantes da fauna límnica, estuarina e marinha, com ênfase na fauna meridional do Brasil. Até o momento foram concluídos estudos com mais de 40 espécies regionais, representando 100 artigos publicados em periódicos científicos nacionais e internacionais. Foram formados até o momento 36 Mestres e 21 Doutores. Os egressos do Grupo de Pesquisa encontram-se trabalhando na UFRGS (Universidade Federal do Rio Grande do Sul, FEEVALE (Centro Universitário FEEVALE), ULBRA (Universidade Luterana do Brasil), UPF (Universidade de Passo Fundo), IBAMA, Fepam (Fundação Estadual de Proteção Ambiental) e Fepagro (Fundação Estadual de Pesquisa Agropecuária), UER (Universidade Estadual de Rondônia), além da própria PUCRS.
