O Nepef tem desenvolvido uma série de atividades desde sua fundação. Dentre as atividades mais importantes destacamos: 1) a manutenção de grupos de pesquisa e de estudos: a) sobre a questão indígena; b) sobre ; c) sobre a questão do Estado. A partir das atividades desenvolvidas pelos grupos de pesquisa e de estudos, tem-se produzido monografias e textos que são apresentados em congressos de cada área de estudo. O Nepef também tem realizado e participado da organização de diverso eventos na área de história no âmbito da Uneal - Palmeira dos Índios.