Visa-se gerar informações sobre o avanço do conhecimento nos corpos de água naturais, em todos os setores nos quais há interferência humana nos recursos hídricos e nos quais o uso humano compete com a sustentabilidade do recurso. As pesquisas abrangem a dinâmica do assoreamento dos reservatórios e sua evolução em termos dos ecossistemas afetados, assim como a aeração e transferência de gases na interface ar-água. Estudos voltados para o balanço hídrico e erosão de diferentes usos e coberturas do solo, bem como estimativas da evapotranspiração em zonas ripárias e áreas de cerrado, por exemplo, também são objetos de trabalho do presente grupo. Adicionalmente, atua-se no estudo da recarga subterrânea na bacia do Ribeirão da Onça. O grupo de pesquisa tem desenvolvido experimentos e simulações numéricas do escoamento em aquíferos e, como a qualidade da água é um aspecto primordial, estudos sobre o transporte de poluentes e contaminação da água subterrânea por lixiviado também são abordados.