A pesquisa na área de doenças infecciosas e parasitárias levará a um conhecimento maior dos aspectos clínicos e epidemiológicos das infecções fúngicas, bacterianas, virais e parasitárias, no estado de Santa Catarina. Também permitirá o desenvolvimento de novas métodologias para o diagnóstico laboratorial das infecções, incluindo métodos avançados em biologia molecular. Possibillitará também avaliar o grau de susceptibilidade in vitro dos agentes infecciosos aos antimicrobianos e antifúngicos e a consequente monitoração da terapêutica instituída ao paciente, assim como o efeito de vários fármacos na evolução clínica das infecções.