O grupo focaliza o estudo da biodiversidade taxonômica e funcional em ecossistemas aquáticos da Bacia do Alto Paraguai, enfocando aspectos de taxonomia e ecologia de espécies, e de diversidade estrutural e características físicas, químicas e biológicas dos ambientes. Aspecto importante é o entendimento do papel da biodiversidade no funcionamneto destes ecossistemas, incluindo fluxos de energia e materiais, e estabilidade dos sistemas. Outro aspecto importante é a relação entre biodiversidade e qualidade ambiental, e o potencial uso no biomonitoramento; estabelecimento de bancos de dados de biodiversidade em ambientes ainda não sofrendo impactos exagerados ou ate prístinos, são de grande importância porque servira como pontos de referência para detectar impactos futuros. Promove o desenvolvimento da capacidade pessoal e institucional (pesquisadores e instituições envolvidas) em estudos de biodiversidade, ecologia aquática e pesquisa limnologica, com treinamento de alunos.
