Este grupo desde 1999 trabalha as questões relacionadas as modificações ambientais em decorrência de processos de ocupação e urbanização acelerada dos espaços naturais em especial bacias hidrográficas. Estas modificações impõem muitas vezes taxas incompatíveis com a capacidade suporte dos ecossistemas e consequentemente da humanidade. Assim a atuação deste Grupo de Pesquisa está fortemente ligada as pesquisas que envolvem geração de dados e Indicadores de qualidade ambiental vinculado ao programa de Pós-Graduação em Saúde e meio Ambiente - PPGSMA se dá em duas em frentes que são interligadas, quais sejam: 1) Gestão e avaliação ambiental de bacias hidrográficas atuando em parceria com o Comitê do complexo hidrológico da Baia da Babitonga e do Rio Itapocu e 2) toxicologia e gestão ambiental propriamente dita em especial de águas doces e marinhas e alguns compostos de maior escala de exposição tais como agrotóxicos e metais pesados. Gerando trabalhos de diagnósticos e proposições.