Este grupo foi criado em resposta aos programas de incentivo ao biodiesel do governo federal e também do Programa Paranaense de Bioenergia, lançado oficialmente em 2004, com dois objetivos principais: viabilizar a tecnologia de produção de matérias primas para obtenção de biodiesel e desenvolver aplicações para os co-produtos. O IAPAR organizou um programa de pesquisa, com equipe multidisciplinar para o desenvolvimento de culturas oleaginosas com potencial para produção de biodiesel, através da mudança na matriz produtiva da região, com inclusão social e de novas opções de renda, propiciando desenvolvimento regional . Busca-se consolidar estratégias e ações visando um novo padrão de desenvolvimento regional que permita melhorar a qualidade de vida da população, com menor impacto ambiental. Atualmente, trabalha-se com culturas de outono-inverno, microalgas, macaúba e avaliações de motores a óleo vegetal. Também existe grande demanda para a produção de bioquerosene para aviação.