O Grupo de Aquicultura da Epagri realiza pesquisa e extensão em maricultura e piscicultura continental em todo o Estado de Santa Catarina.As atividades da Epagri em parceria com universidades têm permitido significativos avanços na produção de peixes e moluscos cultivados no Estado. Santa Catarina é o maior produtor nacional de moluscos bivalves, colocando o Brasil na segunda posição em produção desses organismos na América Latina. As ostras, os mexilhões e as vieiras produzidos pelas fazendas marinhas de Santa Catarina representam 95% da produção nacional.