Após 18 anos como docente da UFRJ, período em que consolidou seu interesse em estudos estruturais e do modo de ação de proteínas tóxicas, em maio de 1997, Celia Carlini tornou-se Professor Titular, do Departamento de Biofísica da UFRGS. A partir de 1998, estabeleceu colaborações com IES gaúchas, como Ulbra, UPF, UNIPAMPA, e pesquisadores do Centro de Biotecnologia da UFRGS, além da UFRJ, UERJ, UFC e no Cenargen. Tem recebido auxílios do CNPq (Editais Universais, Prosul, CBAB), CAPES (Procad, PosDoc-SUS, Ed. Toxinologia), e FAPERGS (PRONEX). Em agosto de 2012, aposentou-se da UFRGS, continuando a atuar nesse IES como docente do PPG Biologia Celular e Molecular. Consultora ad-hoc de agencias de fomento e períodicos, no Brasil e no Exterior, foi Editora Seccional-Bioquímica do Brazilian Journal of Medical and Biological Research, e atualmente é membro do Editorial Board do Toxicon. Até outubro 2016, publicou 110 artigos, que lhe renderam mais de 2000 citações e fator H=23
