O Grupo Multidisciplinar de Bioinformática foi implementado em 2001 com apoio do MCT/CNPq e FAPESC. Atuando na caracterização de sequências de ácidos nucléicos e proteínas, no desenvolvimento de ferramentas computacionais e pipelines científicos para anotação e caracterização de sequencias e na disponibilização de serviços de bioinformática, participa da formação e capacitação de recursos humanos em bioinformática. O grupo mantém colaboração com pesquisadores do LNCC/MCT, do IOC/FIOCRUZ, da UFRGS, da UFMG, do Karolinska Institutet (Suécia) e do CDC (EUA), contando com o suporte da SETIC/UFSC. Os resultados mais significativos do grupo incluem a caracterização estrutural e funcional do genoma e do proteoma do T. rangeli e dos genomas da L. amazonensis, A. deanei, S. culicis e de diferentes genes ou famílias gênicas. Também a produção de sistemas de anotação gênica como o GARSA e STINGRAY. Destaca-se ainda a formação de recursos humanos em diferentes níveis (IC, MSc, PhD).