As pesquisas realizadas pela equipe do Instituto de Pesca, incluindo os Núcleos de Pesquisa do litoral norte (Ubatuba), litoral sul (Cananéia) e NPD Santos, enfocam principalmente o desenvolvimento da atividade de maneira sustentada. O grupo atua diretamente com comunidades pesqueiras com o objetivo de criar alternativas de produção que visam a complementar renda. As espécies pesquisadas são: Crasssotrea brasiliana, Crassostrea gigas, Perna perna, Nodipecten nodosus, Mytella falcata, Mytella guyanensis e Pinctata spp.
