O Grupo de Pesquisa em Ciência e Tecnologia de Micro - organismos (GPCTM) integra pesquisas na área de microbiologia dos alimentos, bem como, na área de identificação de linhagens de interesse na indústria de alimentos. Desde o ano de 2000, através de projetos interinstitucionais, com financiamento de órgãos públicos estaduais (RS) e federais (CNPq), o grupo desenvolve e publica pesquisas com isolamento, identificação e caracterização de cultivos iniciadores, visando o potencial tecnológico de microrganismos para a qualidade dos alimentos. Paralelamente, desde 2007, através da pesquisa de fungos e micotoxinas em alimentos, o grupo publica trabalhos de validação de metodologias de detecção, bem como da epidemiologia nesses substratos.