O grupo de Ecofisiologia e Evolução Molecular vem contribuindo com o estudo das interações dos peixes da Amazônia com seus ambientes há mais de 25 anos. As informações produzidas têm tido significativa repercussão nacional e internacional e ajudam a construir uma base sólida para a aplicação dessas informações. Hoje os estudos se voltam também para a qualidade de ambientes vulneráveis a ações antrópicas na região, incluindo mudanças climáticas, melhoria da piscicultura de espécies de peixes da Amazônia para a recomposição de áreas degradadas e para o consumo humano, e verificação do estado de saúde de peixes ornamentais para exportação. Por meio de estudos de campo e de laboratório, o grupo investiga características genéticas, bioquímicas, fisiológicas, toxicológicas e comportamentais de várias espécies de peixes a fim de subsidiar o uso sustentável da biodiversidade da região ao mesmo tempo em que contribuem com a sua conservação bem como com o monitoramento da qualidade do ambiente.