Nesse grupo de pesquisa busca-se viabilizar aplicações genômicas nas cadeias produtivas de suínos e aves. As pesquisas estão distribuídas em 5 linhas prioritárias: associação global do genoma, metodologias de seleção genômica aplicadas a suínos e aves, prospecção de genes e marcadores relacionados com características de interesse econômico, estudos de expressão gênica e metagenômica. Nos trabalhos com suínos, este grupo representa um esforço de caráter urgente na tentativa de evitar a dependência da suinocultura nacional de programas genéticos internacionais. Dessa forma, foram estabelecidas interações profícuas entre as diversas instituições públicas e o setor privado de melhoramento animal, assumindo postura estratégica de apoio ao desenvolvimento e aumento da competitividade dos programas Nacionais de Melhoramento Genético de Suínos. Já em aves, diferentemente de suínos, em que existe total dependência de material genético, esse grupo lidera as iniciativas nacionais para geração de conhecimento e recursos humanos para garantir a interlocução em genética de aves no País. A equipe é composta por diversas unidades da Embrapa (CNPSA, CNPGL, CNPGC, CPPSul, CNPTIA e CENARGEN) e instituições parceiras (ESALQ/USP, UNESP Jaboticabal, UNESP Botucatu, UFMG, BRF, Universidade Autônoma de Barcelona) reunindo profissionais especializados que detêm competências que se complementam. Entre esses estão os membros dos principais grupos nacionais de pesquisa em bioinformática, genômica e melhoramento animal. Esse grupo apresenta estreita relação com a Rede de Genômica Animal da EMBRAPA, de forma a utilizar e valorizar os esforços já realizados pela rede e, também, contribuindo para a expansão desta com a inclusão de competências e metodologias, sendo oportunidade ideal para a formação de recursos humanos em áreas estratégicas para o País.