O Laboratório de Química de Produtos Naturais tem como missão a busca de substâncias bioativas potencialmente úteis para a prevenção ou tratamento de doenças de interesse para a saúde pública. Para cumpri-la, o grupo adotou a estratégia de realizar a bioprospecção da flora e micota, sendo responsável pela manutenção da Plataforma de Bioprospecção (RPT10A) da Fiocruz, que contempla uma coleção de mais de 20 mil extratos de plantas e fungos coletados no Brasil e Antártica. Estes extratos são utilizados em programas de triagem visando a descoberta de novos produtos naturais bioativos que possam ser úteis para o desenvolvimento de novos fármacos para tratamento e prevenção das leishmanioses, malária, doença de Chagas, tuberculose, doenças virais e câncer. Os extratos ativos são investigados do ponto de vista químico e farmacológico visando o isolamento e a identificação dos princípios ativos.