Dada a importância dos microrganismos na manutenção do balanço ecológico, este grupo almeja a consolidação e competência científica na área do conhecimento da fisiologia, biologia molecular, diversidade e taxonomia dos microrganismos envolvidos com a qualidade dos ecossistemas e em processos biotecnológicos de interesse, a exemplo da biorremediação e recuperação avançada de petróleo. O aprofundamento do conhecimento nesses temas irá propiciar a conservação dos ambientes e dos recursos naturais, bem como a utilização racional do potencial metabólico e fisiológico dos microrganismos. O desenvolvimento de novas metodologias de estudo e o entendimento da estrutura e da função das comunidades microbianas nos ecossistemas também estão entre os objetivos deste grupo.
