A pesquisa do GEPHUR vem se desenvolvendo desde 2003 e se divide em duas Linhas de Pesquisa. A primeira visa a contribuir para o aprofundamento e registro da historiografia da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, investigando a criação e evolução da Instituição, dos diferentes cursos e unidades administrativas, além das principais atividades desenvolvidas internamente, desde sua criação, em 1910, como Escola Superior de Agricultura e Medicina Veterinária, até os dias atuais. Aprofunda estudos referentes à história e memória da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, comparando as políticas educacionais gerais brasileiras com as práticas institucionais. A segunda Linha tem como objetivo o estudo das Instituições Educativas criadas ou recriadas nos anos 1950 e 1960 - momento histórico marcado pelo nacional-desenvolvimentismo - e compreender as experiências voltadas para o Ensino e a Pesquisa ocorridas no âmbito da Campanha de Aperfeiçoamento de Pessoal de nível Superior.