O ambiente marinho e o continente Antártico são nichos potenciais para obtenção de novos produtos biotecnológicos de origem microbiana, pois representam ambientes com características específicas e pouco se conhece sobre a diversidade e os recursos genéticos dos micro-organismos desses ecossistemas. O grupo iniciou os trabalhos referentes a biodiversidade e bioprospecção de fungos marinhos no ano de 2005, a partir do qual vem sendo estruturada uma coleção de fungos recuperados de diversas amostras marinhas, incluindo esponjas, estrelas do mar, ascídias, zoantídeos, algas, sedimento entre outros, coletados no litoral Norte do Estado de São Paulo e no continente Antártico. A coleção de fungos marinhos é constituída por cerca de 800 isolados e a coleção de fungos da Antártica por 1.100 isolados. Essas coleções fazem parte do acervo de pesquisa da Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria (CBMAI) do CPQBA/UNICAMP e da Central de Recursos Microbianos da UNESP (CRM-UNESP).