O Laboratório de Biologia Molecular Microbiana (LABMOM) da UEPG esta credenciado no Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) e na Agência Nacional do Petróleo, Gás Natural e Biocombustível (ANP). No LABMOM são realizadas pesquisas principalmente nas áreas de (1) metagenômica e ecologia molecular microbiana em ecossistemas naturais e antropizados; (2) caracterização bioquímica e molecular de bactérias promotoras do crescimento vegetal; (3) caracterização bioquímica e estrutural de proteínas; (4) transcriptômica e proteômica de plantas; (5) biotecnologia aplicada à interação planta-bacteria etc. A maioria dos pesquisadores desse grupo tem participado de projetos de pesquisa em rede como o INCT-Fixação Biológica de Nitrogênio, GENOPAR, PROTEOPAR, PRONEX, MILLENIUM, MCTI-CT-Agro etc. O LABMOM também conta com a colaboração de pesquisadores e instituições internacionais.