O grupo vem trabalhado ativamente com o setor sucroenergético com pesquisas no sentido do monitoramento microbiológico da fermentação etanólica, avaliação da qualidade dos produtos (etanol, açúcar e energia), prevenção de contaminações bacterianas e leveduras exógenas (incluindo técnicas de biologia molecular), caracterização das linhagens através de técnicas taxonômicas tradicionais, perfil "killer" e identificação de micro-organismos visando a melhoria do rendimento, produtividade. Além disso, quanto à utilização de subprodutos do setor sucroenergético, o grupo vem conduzindo estudos sobre o aproveitamento biotecnológico de vinhaça (remoção de carbono e nitrogênio por células livres e imobilizadas), produção de proteínas e lipídios unicelulares por microalgas e obtenção de produtos de alto valor agregado via cultivo em estado sólido a partir de bagaço de cana-de-açúcar.
