Biologia Computacional Conceito

área de pesquisa

• Representações Cache Eficientes para Montagem de Fragmentos Baseada em Grafos de de Bruijn de Sequências Biológicas
• 3D structural prediction, analysis and validation of Sars-Cov-2 protein molecules
• A comparative pan-genomic analyses of 53 C. pseudotuberculosis strains based on functional domains
• A evolução da complexidade biológica em Eukarya: funções biológicas e domínios de proteínas associados aos número de tipos celulares
• A Plumieridine-Rich Fraction From Allamanda polyantha Inhibits Chitinolytic Activity and Exhibits Antifungal Properties Against Cryptococcus neoformans
• A single unidirectional piRNA cluster similar to the flamenco</i> locus is the major source of EVE-derived transcription and small RNAs in Aedes aegypti</i> mosquitoes
• Abordagens Computacionais do Genoma de Schistosoma mansoni para identificação de Proteínas Potencialmente Imunogênicas
• Adhemar Zerlotini Neto
• Alberto Martin Rivera Dávila
• Alexandre Barbosa de Almeida
• Alexandre Sarmento Queiroga
• Alexsandro Oliveira Alexandrino
• Algoritmo computacional integrativo de regiões diferencialmente metiladas polimórficas específicas da placenta humana revela regiões com assimetrias gamética e somática da metilação.
• Algoritmos eficientes para reconhecimento de grafos de intervalos unitários
• Algoritmos Genéticos para Predição Ab Initio de Estrutura de Proteínas
• Algoritmos para Problemas de Ordenação por Reversões ou Transposições, com Aplicações em Rearranjo de Genomas
• Algoritmos para Reconstrução de Árvores Filogenéticas e o Problema dos Pontos de Recombinação
• Algorítmos Genéticos para Predição Ab Inito de Estrutura de Proteínas
• Alinhamento de sequências por restrição de expressão regular
• Alinhamento de seqüências com rearranjos
• ALTERAÇÕES NOS PADRÕES DE EXPRESSÃO ALELO-ESPECÍFICO SUGEREM PERDA OU GANHO DE IMPRINTING EM NEOPLASÍAS
• Ambiente Computacional para caracterização e identificação de fagos em genomas bacterianos.
• Ana Luiza Martins Karl
• Analise de Informação em Proteínas Homólogas
• Analysis of gene expression in adipocytes of individuals with metabolic syndrome by multivariate statistical methods
• Ancoragem de genoma incompleto em genoma completo
• André Atanasio Maranhão Almeida
• André Chastel Lima
• André Câmara Alves do Nascimento
• André Luiz Pinto Guedes Lourenço
• André Ricardo Oliveira Conson
• Análise da diversidade de splicing alternativo no proteoma de doenças neurodegenerativas.
• Análise da informação mútua em sequências de DNA homólogas.
• Análise de Abordagens Computacionais na Interação SNP-SNP e Aumento no Risco de Doenças
• Análise de Nutrientes Utilizando Redes Metabólicas
• Análise estrutural das regiões de regulação gênica: uma abordagem computacional através de dinâmica molecular
• Análise in silico, in vitro e in vivo do perfil antitrombótico e toxicológico de moléculas sintéticas.
• Aplicações de Métodos Computacionais na Análise Estrutural de de Biorreceptores e Triagem Virtual de Compostos Bioativos
• Approximation Algorithms for Sorting λ-Permutations by λ-Operations
• Arboviruses: The hidden path of an imminent threat
• Arcabouço probabilístico para análise de sequências de RNA
• Armando de Menezes Neto
• Augusto Fernandes Vellozo
• Benilton de Sa Carvalho
• Biblioteca de Fragmentos para a Predição de Estruturas de Proteínas
• Bibliotecas de Fragmentos para a Predição de Estruturas de Proteínas.
• Biologia Pós-Genômica, Computacional e de Sistemas Nanoestruturados
• Carlos Eduardo Guerra Amorim
• Carlos Jose Alvarez Cantero
• Carlos Juliano Moura Viana
• Charles Novaes de Santana
• Classificação de sequências e análise de diversidade em metagenômica
• Combining network-based and matrix factorization to predict novel drug-target interactions: A case study using the Brazilian natural chemical database
• Comparação algébrica de genomas: o caso da distância de reversão
• Computational prediction of protein-ligand interactions using protein's melting curves obtained through nanoDSF
• Construção de Funções Empíricas Utilizando Rede Neural para Determinação de Constamtes de Afinidade Receptor-Ligante
• Dalbert Benjamim da Costa
• Daniel Guimarães tiezzi
• Daniel Saad Nogueira Nunes
• Daniel Santa Cruz Damineli
• Danielle Passos de Ruchkys
• Danilo Fernández Rios
• Davi Vinícius de Lima
• DEGSys
• Desenvolvimento de Estratégias para uso de Mapas de Contato em Problemas de Predição de Estruturas de Proteínas
• Desenvolvimento de metodologias 'de novo' para predição de estruturas de proteínas
• Desenvolvimento de metodologias para predição de estruturas de proteínas independente de moldes
• Desenvolvimento de uma plataforma wev para aprimoramento de análises de pan-genoma a partir da melhoria da montagem de genomas
• Desenvolvimento e Implementação de um Modelo Coarse-grained para Predição de Estruturas de Proteínas.
• Desenvolvimento e Validação de Novos Métodos de Distribuição da População Inicial em Algoritmos Genéticos para o Problema de ``docking" Proteína-Ligante
• DETERMINAÇÃO DE POTENCIAIS SÍTIOS ANTIGÊNICOS PARA A GLICOPROTEÍNA DO ENVELOPE 2 DO VÍRUS MAYARO
• Development of Computational Tool for SNP Interactions
• Differential Gene Expression (DGE) by RNA sequencing analysis and development of software for integrating different DGE methods
• Diogo Fernando Veiga
• Dockthor: Implementação, Aprimoramento e Validação de um Programa de Docking Receptor-Ligante.
• Douglas Eduardo Valente Pires
• Drug repositioning for psychiatric and neurological disorders through a network medicine approach
• Eduardo Arcanjo Urioste
• Elder Magalhães Macambira
• Enumerating Functional Substructures of Genome-Scale Metabolic Networks: Stories, Precursors and Organisations
• ESTRATÉGIAS DE INTEGRAÇÃO DE DADOS EM EXPERIMENTOS DE MICROARRANJOS DE MRNA E DE MIRNA.
• Estudo computacional da interação de compostos naftoquinônicos e a enzima DNA topoisomerase IB humana por modelagem comparativa, docking e dinâmica molecular
• Estudo de Complexos Biomoleculares sob Alta Pressão Hidrostática por Dinâmica Molecular
• Estudo Estrutural e de Propriedades de Reconhecimento Receptor-Ligante dos Alvos IKK-1, IKK-2 e MAPKp38 Utilizando Técnicas de Modelagem Molecular
• Estudos Genomicos de Flexibilidade e Energia Livre Associados à Distribuição de Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)
• Expedient Microwave-Assisted Synthesis of Bis(n)-lophine Analogues as Selective Butyrylcholinesterase Inhibitors: Cytotoxicity Evaluation and Molecular Modelling
• Fabio Carrer Andreis
• Felipe Soares Figueiredo
• Ferramentas para Comparação Genômica.
• Filodinâmica de Elementos Transponíveis e seu uso no controle genético de vetores de doenças infecciosas
• Francisca Ana Soares dos Santos Bronner
• Francisco Flávio de Assunção Rabelo
• Funções de Energia de Solvatação na Predição Ab Initio de Estrutura de Proteínas
• Fábio Lima Custódio
• GAHP - Genetic Algorithm for HP Model
• GAPF - Genetic Algorithm for Protein Folding
• Genome Rearrangement Distance with Reversals, Transpositions, and Indels
• Genômica Comparativa em Ambiente Computacional Distribuído: Aplicabilidade e Potencial no Estudo de Homologia entre Protozoários
• Genômica de Filárias da Amazônia Brasileira
• Gerenciamento de Workflows Científicos em Bioinformática.
• Gisnayle Ana da Silva Pereira
• Gregório Takashi Higashikawa
• Guilherme Duarte Ramos Matos
• Guilherme Henrique Santos Miranda
• Gustavo Rodrigues Galvão
• Habib Asseiss Neto
• Heurística híbrida para o problema da predição da estrutura de proteínas utilizando o modelo Hidrofóbico-Polar
• Identificação de candidatos a biomarcadores de rejeição em transplante cardíaco a partir de transcriptomas : revisão sistemática e meta-análise
• Identificação de cianobactérias na Lagoa Salgada por abordagem metagenômica, Rio de Janeiro, Brasil
• Identificação e análise de co-expressão in sílico de genes codificadores de proteínas associadas a transcrição e de enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) da cultivar SP80-3280
• Identificação estatística de regiões codificadoras de proteínas em seqüências de DNA
• Identificação in vitro e in silico do perfil antitrombótico de moléculas sintéticas / In vitro and in silico identification of novel synthetic molecules with antithrombotic profile
• Implementação e Análise de Modelos de Solvatação para a Predição Ab Initio de Estruturas de Proteínas
• Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano.
• Improving Blind Docking in DOCK6 through an Automated Preliminary Fragment Probing Strategy
• In Silico Analysis of Dengue Virus Serotype 2 Mutations Detected at the Intrahost Level in Patients with Different Clinical Outcomes
• Indentificação de Genes por comparação de DNAs
• Integração de bases de dados administrativos com ferramentas genômicas
• Ivan Mazoni
• Ivan Rodrigo Wolf
• Jaime Manuel Pinto Combadão
• Jakelyne Machado Lima Silva
• Jean-Marc Schwartz
• Jeane Cec¿lia Bezerra de Melo
• Jersey Heitor da Silva Maués
• Jesus Vinícius da Silva
• Jorge Augusto Hongo
• Jose Gilberto Jardine
• José Deney Alves de Araújo
• José Ricardo de Souza Barradas
• João Paulo Pereira Zanetti
• João Victor da Silva Guerra
• Length-weighted $$lambda $$-rearrangement distance
• Lilian Hernandez Alvarez
• LIN TZY LI
• Lise Rommel Romero Navarrete
• Lucas de Almeida Machado
• Luciana de Souza Pessoa
• LUCIANA MÁRCIA DE OLIVEIRA
• Luciano Antonio Digiampietri
• Luiz Carlos da Silva Rozante
• Machine learning approaches reveal genomic regions associated with sugarcane brown rust resistance
• Maithê Gaspar Pontes Magalhães
• Marcelo Cezar Pinto
• Marcelo da Silva Reis
• Marcus de Barros Braga
• Maria Priscila Franco Lacerda
• MARIANA RECAMONDE MENDOZA
• Matheus Bersot Siqueira Barros
• Mauricio Egidio Cantão
• Maurício Vieira Kritz
• Medidas de Distância e Similaridade em Genômica Comparativa
• Medusa: um fluxo de trabalho para classificação taxonômica e anotação funcional de metagenomas.
• Metodologia de classificação de sequências de proteínas do fungo Metarhizium anisopliae utilizando técnicas de aprendizagem de máquina
• METROID: an automated method for robust quantification of subcellular fluorescence events at low SNR
• Modelagem Molecular da Ribose-5-fosfato isomerase de Leishmania major e de Homo sapiens: Predição de Estruturas e Estudos de Atracamento Molecular.
• MODELOS COMPUTACIONAIS PARA IDENTIFICAÇÃO DE INFORMAÇÃO GENÔMICA ASSOCIADA À RESISTÊNCIA AO CARRAPATO BOVINO
• Montagem de Fragmentos de DNA pelo Método 'Ordered Shotgun Sequencing (OSS)'.
• Márcio Luiz Magrini
• Márick Rodrigues Starick
• Métodos Computacionais para Identificação de Módulos Regulatórios Transcricionais (Provisório)
• Métodos Computacionais para o Cálculo de Estruturas de Proteínas: Aproximando o Problema Molecular de Geometria de Distâncias de Dados de Ressonância Magnética Nuclear
• Nalvo Franco de Almeida Júnior
• Nelson Peixoto Kotowski Filho
• O problema do alinhamento de segmentos
• On the Complexity of Some Variations of Sorting by Transpositions
• Ordenação de permutações por operações de tamanho limitado
• Otávio José Bernardes Brustolini
• Parametrização de anéis aromáticos comumente usados no desenvolvimento de fármacos e química medicinal
• Paulo Eduardo Ambrósio
• Paulo Gustavo Soares da Fonseca
• PAULO SERGIO LOPES DE OLIVEIRA
• Paulo Sávio da Silva Costa
• Paulo Vieira Milreu
• Population¿based prevalence surveys during the Covid¿19 pandemic: A systematic review
• Priscila da Silva Figueiredo Celestino Gomes
• Priscila do Nascimento Biller
• Problemas de Ordenação de Permutações por Operações Ponderadas
• Profrager
• Protein structure comparison via contact map alignment
• Rafael Mathias Ferreira
• Rafael Viana de Carvalho
• Raíssa Santos de Lima Rosa
• Rearranjo em Genomas
• Reconhecimento de Padrões e Redes Neurais Artificiais em Predição de Estruturas Secundárias de Proteínas
• Reginaldo Massanobu Kuroshu
• Reinaldo Souza de Oliveira Júnior
• Renatha Oliva Capua
• Resolução de Estruturas de Proteínas utilizando-se Dados de RMN a partir de um Algoritmo Genético de Múltiplos Mínimos
• Ricardo Zorzoretto Niconiello Vêncio
• ROBSON PARMEZAN BONIDIA
• ROMMEL THIAGO JUCÁ RAMOS
• Ronaldo Fiorilo dos Santos
• Roosevelt Alves da Silva
• SIMBA (Grupo de Pesquisa em Sistemas de Informações, Multimídia e Bancos de Dados)
• Sistema de agentes para coleta de informações em ambiente distribuído e heterogêneo
• Solange Guimarães
• Structure-Guided Computational Approaches to Unravel Druggable Proteomic Landscape of Mycobacterium leprae
• Sustentabilidade em uma estrutura de sistemas integrados.
• Tathiane Maistro Malta
• Thais Guimarães Martins Nery
• Tânia Carlice Lopes Pereira dos Reis
• Técnicas de Bioinformática e Modelagem Computacional Aplicadas ao Estudo do Genoma de Trypanosoma cruzi e de Enzimas Consideradas de Interesse no Tratamento da Doença de Chagas
• Técnicas para Construção de Árvores Filogenéticas
• Um algoritmo de aproximação paralelo para transversal mínima com aplicação em análise da expressão gênica
• Um Algoritmo para Comparação Sintática de Genomas baseado na Complexidade Condicional de Kolmogorov.
• Uma abordagem de Medicina de Redes revela mecanismos moleculares e novas drogas candidatas para doenças neuropsiquiátricas, infecciosas e inflamatórias crônicas
• Uma Ferramenta de Auditoria para Algoritmos de Rearranjo de Genomas
• UMA NOVA ABORDAGEM PARA DETECÇÃO E ELIMINAÇÃO DE REDUNDÂNCIA EM CONTIGS NGS NA FINALIZAÇÃO DE GENOMAS PROCARIOTOS UTILIZANDO BLOOM FILTER E LSH
• Uma Nova Abordagem para Pesquisa Paralela em Bancos de Dados Biológicos Utilizando Algoritmos de Comparação de Seqüências Baseados em Programação Dinâmica
• Vagner Katsumi Okura
• Valor Prognóstico de Assinaturas de Expressão Diferencial dos Genes do Sistema de Oxidação Fosforilativa (OXPHOS) em Câncer
• Variação interindividual pervasiva na expressão alelo-específica em gêmeos monozigóticos
• Vinicius Campista Brum
• Viviane Schuch
• Whole Genome Comparison using a Multithreaded Parallel Implementation
• Yuri Tani Utsunomiya
• Állan Jhonathan Ramos Ferrari