O CECANE-SC foi criado a partir de pacto firmado entre o Fundo Nacional de Desenvolvimento da Educação (FNDE) e a Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), mediante descentralização orçamentária, de acordo com Resolução nº 019/2005 - FNDE.Os objetivos do CECANE-SC são: 1) Capacitação de agentes envolvidos no planejamento, gestão e execução do Programa Nacional de Alimentação Escolar (PNAE) no Estado de Santa Catarina (SC). 2) Projetos de extensão universitária voltados ao desenvolvimento de estratégias para a garantia da alimentação escolar saudável. 3) Projetos de pesquisa na área de alimentação e nutrição escolar. 4) Apoio técnico/ assessoria aos municípios de SC na no planejamento, gestão e execução do PNAE. O CECANE-SC foi criado a partir da portaria nº 192/2008, Gabinete do Reitor da UFSC. Recebeu apoio financeiro por meio de descentralização orçamentária do FNDE para UFSC nos anos de 2007 a 2022.