O LEPSI foi instituído em 1998 na Universidade de São Paulo à iniciativa de Maria Cristina Kupfer (IPUSP) e de Leandro de Lajonquière (FEUSP). A partir de 2013 outros docentes-pesquidores além da USP passaram a integra-lo: UNIFESP, UFOP, UFMG dando lugar dessa forma a duas sedes do laboratório : LEPSI São Paulo e LEPSI Minas. Oferta regularmente atividades acadêmicas junto aos programas de pós-graduação em Educação e em Psicologia em Minas e em SP, organiza Colóquios Internacionais com a participação de convidados do exterior e de outras universidades brasileiras, e acolhe jovens pesquisadores na modalidade Comunicações Livres. O LEPSI São Paulo é responsável pela edição do periódico científico Estilos da Clínica: Revista Sobre a Infância com Problemas, com selo editorial IPUSP. Participa da rede de pesquisa latino-americana INFEIES sobre a infância e suas instituições, bem como mantém estreita colaboração com grupo de pesquisa francês CLIOPSY.